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大多数水源溶解性二氧化硅(SiO2)的含量在1~100mg/L。过饱和SO能够自动聚合形成不溶性的胶体硅或胶状硅，引膜的污染。浓水中的最大允许SiO2浓度取决于SiOz的溶解度。

浓水中硅的结垢倾向与进水中的情形不同，这是因为SiO2浓度增加的同时，浓水的pH值也在变化，这样SiOz的结垢计要根据原水水质分析和反渗透的操作参数(回收率)而定。

如果出现一定量的金属，如A13+的话，可能会通过形成金属硅酸盐改变SiO2的溶解度。硅结垢的发生大多数为水中存在铁。因此，如果存在硅的话，应保证水中没有铝或铁，并且推荐使用1um的保安滤器滤芯，同时采取预防性的酸性清措施。

为了提高回收率，进行石灰一纯碱软化预处理时，应添加氧化镁或铝酸钠以减少进水中的 SiOz浓度，同时确保软化过程有效运转十分重要，以防止反渗透系统会出现难溶金属硅酸盐;

由于pH值低于7或高于7.8，可以增加硅的溶解度，就防止硅的结垢而言，加酸或加碱可以提高水的回收率，但在高pH条件下，要防止 CaCO3的沉淀;

当采用热交换器增加进水温度时，就二氧化硅的结垢而言，可以显著地提高水的回收率，但膜系统的最高允许温度为45°℃;

高分子量的聚丙烯酸酯阻垢剂可以用于增加二氧化硅的溶解度。

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